แนวทางใหม่ที่เร็วแล้วก็มีคุณภาพในการสร้างโปรไฟล์ของเซลล์ผู้เดียว

หลายเซลล์ในร่างกายของเราดำเนินการในลักษณะปกปิดวิทยาศาสตร์ที่ยังไม่เข้าใจ ที่ยังไปสำหรับเซลล์ภูมิคุ้มกันที่มีความหมายสำหรับในการคุ้มครองพวกเราจากโรครุนแรง

เพื่อที่จะเอาชนะปัญหานี้นักวิจัยพยายามอย่างยิ่งสำหรับในการหาวิธีใหม่ในการค้นคว้าผลงานด้านในของเซลล์แต่ละเซลล์

ความท้าเป็นไม่เพียงแต่ แต่จะแยกเซลล์ออกมาจากตัวอย่างเนื้อเยื่อยิ่งไปกว่านี้เรายังจำเป็นต้องหาวิธีการวิเคราะห์รูปแบบการทำงานของเซลล์แต่ละเซลล์ด้วย” ดร. เคดาร์นาธานท้องนาน้ำผู้ช่วยศาสตราจารย์และหัวหน้างานศึกษาค้นคว้าภาควิชาวิชาชีวเคมีและก็ชีววิทยาระดับโมเลกุลกล่าว มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นเดนมาร์ก

ในการศึกษาวิจัยใหม่นำโดย Kedar Nath Natarajan และก็ Xi Chen จากสถาบัน Wellcome Sanger Institute ทีมวิจัยได้ปรับปรุงกรรมวิธีใหม่ในการทำเป็นชิ้นเล็กชิ้นเล็กด้านในอวัยวะและเนื้อเยื่อของกล้องจุลทรรศน์

วิธีการใหม่ช่วยทำให้พวกเขาสามารถพินิจพิจารณาเซลล์ได้มากกว่า 3000 เซลล์จากม้ามซึ่งเป็นจุดที่มีฮอตปอสำหรับเซลล์ภูมิต้านทานทุกจำพวก เซลล์ที่ต่อสู้กับการได้รับเชื้อ แต่ว่ายังเป็นเหตุให้ภูมิต้านทานในชีวิตประจำวันแล้วก็การตอบสนอง

วิธีการใหม่ๆได้รับการพัฒนาอย่างสม่ำเสมอเพื่อแสดงรายละเอียดของเซลล์ลำพังข้างในอวัยวะแล้วก็เนื้อเยื่อ วิธีการเป็นการศึกษาเล่าเรียนต้นแบบรากฐานของสิ่งมีชีวิตตัวอย่างเช่น DNA และกรรมวิธีบรรจุข้างในเซลล์เดียว บรรจุภัณฑ์นี้เรียกว่า chromatin รวมทั้งสัญญาณที่ยีนข้างในพิมพ์เขียวถูกเปิดแล้วก็ปิดดังนั้นจึงตรึกตรองว่าจะกลายเป็นเซลล์เม็ดเลือดเซลล์ผิวหนังเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์มะเร็งหรือเซลล์ประเภทอื่น

กรรมวิธีใหม่ของเราสำหรับการทำให้โครเมียมด้านในเซลล์เดียวมีทางเลือกที่มีประสิทธิภาพสามารถปรับขนาดได้และถูกกว่าสำหรับวิธีการที่นำสมัยที่สุดซึ่งจำเป็นที่จะต้องมีส่วนประกอบเบื้องต้นที่ราคาแพงแพงเครื่องใช้ไม้สอยพิเศษและเครื่องมือต่างๆ” นายติดอยู่เดรนาธัตนานันกล่า

ร่วมกับผู้เขียน Xi Chen คนแรกจากสถาบัน Wellcome Sanger Institute เขาเป็นหัวหน้าในการพัฒนาวิธีการใหม่ๆและสร้างรายละเอียดเกี่ยวกับเซลล์ต่างๆดังเช่นว่าเซลล์ภูมิต้านทานเซลล์ต้นกำเนิดฯลฯผู้ร่วมวิจัยจากสถาบัน Wellcome Sanger ตัวอย่างเช่น Ricardo J Miragaia และงานนี้ได้รับการทำงานในห้องทดลองของผู้เขียน Sarah A Teichmann ที่เกี่ยวเนื่อง

บทสรุปย่อของกระดาษให้คำชี้แจงนี้:

การตรวจหาลำดับเบสของ transposase-chromatography (ATAC-seq) ใช้กันอย่างแพร่หลายเพื่อกำหนดขอบเขตของกฎระเบียบทั่วอีกทั้งจีโนม อย่างไรก็ตามการเรียนรู้จำนวนน้อยได้รับการจัดการในระดับเซลล์เดี่ยว(scATAC-seq) เนื่องจากความท้าทายทางเทคนิค ตรงนี้เราได้พัฒนาวิธีการ scATACseq ที่เรียบง่ายและก็มีประสิทธิภาพโดยใช้การรวมแท็ก Tn5 ที่มีการเรียงsingle-nuclei พวกเราแสดงให้เห็นว่าแนวทางการของเราสามารถดำเนินงานได้อย่างสะดวกในระบบต่างๆและก็เซลล์ที่สดและก็เก็บรักษาได้จากเยื่อหลัก โดยทำโปรไฟล์มากกว่า 3,000 splenocytes พวกเราจะเจาะจงประเภทของเซลล์ภูมิคุ้มกันที่แตกต่างออกไปรวมทั้งแสดงขอบเขตการกำกับดูแลเฉพาะที่เกี่ยวพันกับเซลล์และเหตุการถอดรหัสที่เกี่ยวพัน